Cell | 免疫疾病中淋巴细胞特异基因调控动态全景图

日本大学的研究课题医护人员和RIKEN Research研究课题所的同事们不太可能成立了首个针对自身免疫反应性癌症和自身水肿性癌症的等位基因统计数据库。希望这一水资源能为免疫反应癌症的的发展提供属于自己论述，并显然有助于药物的注意到。科学家们还希望，与免疫反应特别的等位基因序列统计数据图谱事与愿违显然应用于诸如COVID-19等霍乱的研究课题。

日本大学项目研究课题助理，外科风湿病学家，基本功能等位基因序列学专家Mineto Ota博士问道：“要认识到癌症，就必须深刻理解等位基因反转的基本功能。有了这个统计数据集，我们就可以将与癌症特别的DNA核苷酸转变的统计数据与对癌症发病机制非常重要的等位基因和蛋白质种类保持联系起来。”Ota是该一个团队发表在《Cell》杂志上的文章的主要笔记，文章标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的科学家们合作开展的。

笔记确信，免疫反应细胞内的癌症（IMD）最主要从自身免疫反应性到自身水肿的多种病理。他们认为，尽管IMD中所炎性蛋白质因子的诱发社会活动问道明了免疫反应蛋白质基本功能发生了转变，但是，“对于IMD的特别等位基因甚至特别蛋白质种类知之甚少。”

仅有等位基因序列关连性研究课题（GWAS）注意到了许多与IMD特别的等位基因序列亚基。但是，在此类关连性研究课题中所鉴定显露的许多等位基因反转都座落通气等位基因“on”或“off”解读的DNA非编码区域，而不是座落等位基因编码核苷酸中所。研究课题组认为：“GWAS不太可能揭示了许多与复杂变异和癌症特别的等位基因序列亚基，最主要IMD。这些反转中所的大多数都座落非编码等位基因序列区域，特别是抑制器件，如增强子和启动子。”

为了揭示抑制DNA的基本功能，一种各有不同种类的等位基因序列分析，统称解读一原理变异等位基因亚基（eQTL），主旨将DNA核苷酸的差异与等位表观的差异保持联系起来。运用eQTL统计数据，研究课题医护人员可以对抑制DNA核苷酸的意在、抑制核苷酸中所的反转如何影响其抑制等位基因的解读以及这些等位表观差异如何导致癌症做显露更加明智的推测。

其它针对免疫反应的eQTL研究课题不太可能在开展中所，但先前的研究课题工作只最主要身心健康青年人，并检查了受限生产量的蛋白质种类。研究课题医护人员确信：“对身心健康ADP免疫反应蛋白质的研究课题显然无法捕获癌症静止状态下注意到的一系列eQTL震荡。此外，虽然对免疫反应蛋白质的实验性刺激可以在某种程度上三维癌症静止状态，但不一定常常突显显露体内的生理环境。”

Ota补充道：“水肿静止状态下，免疫反应蛋白质的物理物理性质与身心健康静止状态下的相异蛋白质截然各有不同。与免疫反应状况特别的等位基因反转显然只在患病静止状态下起作用，因此对于这种种类的等位基因研究课题，从真实病变身上获取样本非常重要。”

在他们最新新闻报道的研究课题中所，研究课题组对79名身心健康青年人和337名被检验患有10种各有不同种类免疫反应细胞内癌症（最主要类风湿性关节炎、全面性狼疮和全面性硬化症）的病变开展了仅有等位基因序列高通量。所有青年人都是日本帝国混血儿。

认识到免疫反应细胞内的癌症有着挑战性，因为尽管每种癌症在外科上都是各有不同的，但仍有许多交叉之处，并且有着相异检验的病变显然会表现显露非常各有不同的症状。研究课题医护人员补充问道：“由于所有这些社会性，一次进修一种免疫反应细胞内癌症的灵活性是受限的。但是，如果我们独自研究课题10种癌症，就可以更加仅有面地认识到这些种类的癌症。”

在顺利进行仅有等位基因序列高通量后，研究课题医护人员从青年人的血液样本中所分离显露28种各有不同种类的免疫反应特别蛋白质，并测量了这些蛋白质中所的等位表观。“我们在图谱中所看到，每种免疫反应蛋白质种类都有各有不同的eQTL结果，这可以说道我们蛋白质种类中间等位基因抑制的差异，以及哪种蛋白质种类对于的发展哪种癌症至关重要。”研究课题医护人员问道。

笔记报告问道，“在等位表观分析中所，我们在一个该平台上对多个IMD开展非常，使我们能够描述每个癌症（病变）的特征，并鉴别与单个癌症酪氨酸特别的等位基因，以及在都由IMD中所失调的通路……我们的统计数据集使我们能够监测每个特定蛋白质种类中所eQTL震荡的生理（癌症）背景转子的依赖性。”

研究课题医护人员将给予的水资源取名为日本大学免疫反应蛋白质等位表观图谱（ImmuNexUT），并问道它代表者了使用东亚混血儿青年人成立的远超过的eQTL统计数据集。他们说明了道：“我们确定了免疫反应蛋白质种类酪氨酸的eQTL震荡，最主要以前未新闻报道的罕见蛋白质种类，它们在生理水肿条件下的社会性，以及这些eQTL与IMD变异中间的显著关连性。”

“到目前为止，在这一领域，大规模的等位基因序列和基本功能等位基因序列研究课题主要是运用欧洲捐**开展的，尽管群体社会性对于正确地理解等位基因序列基本功能至关重要。”研究课题医护人员问道，“这个日本帝国病患的eQTL图谱对于借助这种以欧洲为中所心的成见，混合欧洲的统计数据集进一步研究课题DNA反转的基本功能，也有着重要意义。”

研究课题医护人员希望ImmuNexUT统计数据库将继续持续增长，并事与愿违为病变造成了更加好的结果。他们问道：“与之前新闻报道的水资源比起，我们的统计数据集有着鲜明而险恶的特点，最主要仅有面的免疫反应蛋白质细分、捐**中间免疫反应状况的转变以及同质的非欧洲捐**。”